Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC94Q9BW85 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC94Q9BW85 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms