Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMUB1Q9BVT8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms