Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms