Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms