Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms