Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms