Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms