Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms