Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYBPQ8N488 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms