Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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