Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML1Q86YW5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms