Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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USP53Q70EK8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
USP53Q70EK8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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