Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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