Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
FRMD7Q6ZUT3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FRMD7Q6ZUT3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms