Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms