Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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