Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms