Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms