Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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