Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms