Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCK2Q16822 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCK2Q16822 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCK2Q16822 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms