Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms