Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRF1Q16656 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRF1Q16656 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRF1Q16656 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms