Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms