Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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