Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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