Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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