Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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