Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms