Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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