Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EEA1Q15075 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms