Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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