Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IKBKEQ14164 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms