Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms