Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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