Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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