Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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