Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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