Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms