Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTK7Q13308 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms