Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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