Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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