Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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