Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
STX4Q12846 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
STX4Q12846 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
STX4Q12846 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
STX4Q12846 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
STX4Q12846 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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