Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms