Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms