Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms