Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms