Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.5 ms