Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms